Las marcadas discrepancias y la falta de coordinación al interior del Órgano Judicial han comenzado a paralizar y frenar la resolución de diversos temas de alta relevancia institucional en el país. Diversos conflictos como la cuestionada convocatoria externa del Consejo de la Magistratura para designar jueces libres ignorando a los egresados de la Escuela de Jueces del Estado (EJE), las pugnas por la tuición de la Ley del Notariado y las modificaciones al régimen disciplinario cuestionadas por la Amabol y la FLAM ponen en evidencia posturas divididas entre las propias autoridades y consejeros.

A esta compleja coyuntura se suman duros enfrentamientos políticos e institucionales, como la polémica remoción de la presidencia en el TDJ de Beni que derivó en cruces de acusaciones entre el presidente del TSJ y vocales departamentales, así como la postergación e incertidumbre en la realización del taller para la planificación del POA 2027. Representantes de la Asociación de Magistrados de Bolivia (Amabol) y de la Asociación de Magistrados de Chuquisaca lamentaron públicamente esta evidente falta de consenso e interrelación entre el Consejo de la Magistratura, el TSJ y la EJE, advirtiendo que las decisiones unilaterales terminan por perjudicar la carrera judicial, la estabilidad y la administración de justicia en el Estado.